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全基因組測序檢測

原創(chuàng)發(fā)布者:北檢院    發(fā)布時間:2025-04-09     點擊數(shù):

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標題:全基因組測序技術(shù)解析:從樣品到數(shù)據(jù)的科學探索

導語 全基因組測序(Whole Genome Sequencing, WGS)作為現(xiàn)代生命科學的核心技術(shù)之一,能夠全面解析生物體的遺傳信息。本文從實際檢測流程出發(fā),詳細介紹全基因組測序的樣品要求、檢測項目、方法原理及儀器設備,為科研與臨床應用提供參考。

一、檢測樣品

全基因組測序?qū)悠返馁|(zhì)量和純度要求較高。常規(guī)檢測樣品包括:

  • 人體樣本:如外周血(需EDTA抗凝全血)、唾液、組織切片(新鮮或石蠟包埋)等,要求DNA總量≥1 μg,濃度≥20 ng/μL,OD260/280值在1.8~2.0之間。
  • 微生物與動植物樣本:需根據(jù)物種特性進行細胞裂解和DNA提取,避免多糖、色素等雜質(zhì)干擾。

二、檢測項目

全基因組測序涵蓋以下核心分析內(nèi)容:

  1. 基因組組裝與注釋:通過比對參考基因組,識別基因結(jié)構(gòu)及功能元件。
  2. 變異檢測:包括單核苷酸多態(tài)性(SNV)、插入缺失(InDel)、拷貝數(shù)變異(CNV)及結(jié)構(gòu)變異(SV)。
  3. 個性化分析:如疾病相關(guān)突變篩查、遺傳進化分析、藥物代謝基因解讀等。

三、檢測方法

1. 文庫構(gòu)建 采用超聲破碎或酶切法將DNA片段化,經(jīng)末端修復、加接頭和PCR擴增,制備適合測序的DNA文庫。

2. 測序技術(shù) 基于Illumina邊合成邊測序(Sequencing By Synthesis, SBS)原理,通過熒光信號采集實現(xiàn)高通量并行測序。讀長支持PE150(雙端150 bp),覆蓋度≥30×。

3. 數(shù)據(jù)分析 原始數(shù)據(jù)經(jīng)質(zhì)控過濾后,通過BWA、GATK等工具進行序列比對和變異識別,結(jié)合ANNOVAR、SnpEff等軟件完成功能注釋。

四、檢測儀器

全基因組測序依賴高精度儀器設備,主要包括:

  • 測序儀:Illumina NovaSeq 6000,支持單次運行輸出最高6 Tb數(shù)據(jù),適用于大規(guī)模基因組項目。
  • 輔助設備:Qubit 4.0熒光定量儀(DNA定量)、Agilent 4200 TapeStation(文庫質(zhì)控)、超算集群(數(shù)據(jù)分析)。

結(jié)語

全基因組測序技術(shù)正逐步推動精準醫(yī)學和農(nóng)業(yè)育種等領(lǐng)域的發(fā)展。通過標準化樣品處理、高效測序平臺與智能化分析流程的結(jié)合,未來將進一步提升基因組數(shù)據(jù)的應用價值。

(本文內(nèi)容基于實驗室標準流程撰寫,具體檢測方案需結(jié)合實際需求調(diào)整。)

實驗儀器

實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器

測試流程

全基因組測序檢測流程

注意事項

1.具體的試驗周期以工程師告知的為準。

2.文章中的圖片或者標準以及具體的試驗方案僅供參考,因為每個樣品和項目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準。

3.關(guān)于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗周期一般是五個工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對于(全基因組測序檢測)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

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