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全基因組外顯子測序檢測

原創(chuàng)發(fā)布者:北檢院    發(fā)布時間:2025-04-09     點擊數(shù):

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全基因組外顯子測序檢測技術(shù)解析

隨著精準醫(yī)學的快速發(fā)展,全基因組外顯子測序(Whole Exome Sequencing, WES)已成為遺傳性疾病研究、腫瘤基因組分析及個體化醫(yī)療的重要工具。本文將從檢測樣品、檢測項目、檢測方法及檢測儀器四個方面,系統(tǒng)介紹全基因組外顯子測序的關(guān)鍵技術(shù)流程。

一、檢測樣品

全基因組外顯子測序的檢測樣品類型多樣,主要包括以下三類:

  1. 外周血樣本:通過采集受檢者靜脈血,提取基因組DNA,適用于遺傳性疾病篩查及健康人群的基因變異分析。
  2. 組織樣本:如腫瘤組織或病變組織,用于探究體細胞突變與疾病發(fā)生發(fā)展的關(guān)聯(lián)。
  3. 唾液或口腔拭子:非侵入性采樣方式,便于大規(guī)模人群研究或家系分析。

所有樣本需嚴格按照生物安全標準進行預處理,確保DNA質(zhì)量符合測序要求。

二、檢測項目

全基因組外顯子測序的核心目標是捕獲人類基因組中約2%的外顯子區(qū)域(約30,000個基因),涵蓋已知的蛋白編碼序列及部分調(diào)控區(qū)域。具體檢測項目包括:

  • 基因突變檢測:識別單核苷酸變異(SNV)、插入缺失(Indel)及拷貝數(shù)變異(CNV)。
  • 疾病關(guān)聯(lián)分析:通過比對公共數(shù)據(jù)庫(如ClinVar、OMIM),解析變異與疾病的相關(guān)性。
  • 遺傳咨詢支持:為家族性遺傳病提供致病基因定位及風險評估。
  • 藥物基因組學:分析藥物代謝相關(guān)基因的變異,指導個體化用藥。

三、檢測方法

全基因組外顯子測序的技術(shù)流程分為以下關(guān)鍵步驟:

  1. DNA提取與質(zhì)檢:使用磁珠法或酚-氯仿法提取樣本DNA,并通過分光光度計或熒光定量儀評估DNA濃度及純度。
  2. 文庫構(gòu)建:將DNA片段化后,連接測序接頭,構(gòu)建適用于高通量測序的DNA文庫。
  3. 外顯子捕獲:采用液相雜交技術(shù)(如Agilent SureSelect、Illumina Nextera)特異性富集外顯子區(qū)域。
  4. 高通量測序:基于邊合成邊測序(SBS)原理,在測序儀上完成雙端測序(PE150),覆蓋目標區(qū)域平均深度≥100×。
  5. 生物信息學分析:通過比對參考基因組(如GRCh38)、變異注釋及功能預測,生成臨床可解讀的檢測報告。

四、檢測儀器

全基因組外顯子測序依賴于高精度儀器與配套試劑,核心設備包括:

  • 測序平臺:Illumina NovaSeq 6000、HiSeq X Ten或Thermo Fisher Ion S5系列,支持大規(guī)模并行測序。
  • 捕獲系統(tǒng):Agilent Bravo自動化工作站,用于高效完成外顯子區(qū)域捕獲。
  • 質(zhì)檢設備:Qubit熒光定量儀(Thermo Fisher)、Bioanalyzer 2100(Agilent),確保文庫質(zhì)量達標。
  • 數(shù)據(jù)分析平臺:高性能計算集群(HPCC)及分析軟件(如GATK、ANNOVAR),實現(xiàn)快速數(shù)據(jù)處理與變異解讀。

結(jié)語

全基因組外顯子測序通過高分辨率、高通量的技術(shù)優(yōu)勢,為疾病機制研究、臨床診斷及治療提供了強有力的工具。隨著測序成本的降低和數(shù)據(jù)分析能力的提升,其應用范圍將進一步拓展,推動精準醫(yī)學邁向新的發(fā)展階段。


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全基因組外顯子測序檢測流程

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2.文章中的圖片或者標準以及具體的試驗方案僅供參考,因為每個樣品和項目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準。

3.關(guān)于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗周期一般是五個工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對于(全基因組外顯子測序檢測)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

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