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蛋白質(zhì)組學檢測

原創(chuàng)發(fā)布者:北檢院    發(fā)布時間:2025-04-09     點擊數(shù):

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基于蛋白質(zhì)組學的樣本檢測分析報告

引言

蛋白質(zhì)組學作為系統(tǒng)生物學研究的重要分支,能夠全面揭示生物體內(nèi)蛋白質(zhì)的表達、修飾及相互作用信息。本研究通過高通量蛋白質(zhì)組學技術(shù)對目標樣本進行深度分析,為后續(xù)功能研究與臨床應(yīng)用提供數(shù)據(jù)支持。

檢測樣品

本次檢測的樣本類型為人類肝癌組織與癌旁正常組織(各5例),樣本采集后經(jīng)液氮速凍并保存于-80℃超低溫冰箱。所有樣本均通過倫理審查,確保符合生物醫(yī)學研究規(guī)范。

檢測項目

  1. 蛋白質(zhì)表達譜分析:鑒定樣本中差異表達蛋白;
  2. 蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析:重點關(guān)注磷酸化與泛素化修飾;
  3. 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò):構(gòu)建關(guān)鍵蛋白的功能調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。

檢測方法

  1. 樣品前處理 采用FASP(Filter-Aided Sample Preparation)法進行蛋白質(zhì)提取與酶解,使用胰蛋白酶將蛋白質(zhì)消化為肽段,并經(jīng)C18固相萃取柱脫鹽純化。

  2. 液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS/MS) 肽段混合物通過納升級液相色譜系統(tǒng)(EASY-nLC 1200)分離,以色譜梯度洗脫后進入高分辨質(zhì)譜儀進行分析。質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集模式為DDA(Data-Dependent Acquisition),掃描范圍覆蓋m/z 350-1500。

  3. 數(shù)據(jù)分析 原始數(shù)據(jù)經(jīng)MaxQuant軟件處理,匹配UniProt人類蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進行定性定量分析。差異蛋白篩選標準為:Fold Change ≥2.0或≤0.5,p值<0.05;功能注釋通過GO、KEGG數(shù)據(jù)庫完成。

檢測儀器

  1. 質(zhì)譜儀:Thermo Fisher Orbitrap Fusion Lumos;
  2. 液相色譜儀:Thermo Scientific EASY-nLC 1200;
  3. 離心機:Eppendorf Centrifuge 5424R;
  4. 超聲波破碎儀:Covaris M220 Focused-ultrasonicator。

結(jié)果與結(jié)論

本研究共鑒定到5,200種蛋白質(zhì),其中肝癌組織與癌旁組織間差異表達蛋白326個(上調(diào)162個,下調(diào)164個)。顯著富集的通路包括“PI3K-AKT信號通路”和“代謝重編程”。此外,磷酸化修飾分析提示EGFR、STAT3等蛋白的異常激活可能與腫瘤進展相關(guān)。

結(jié)語

蛋白質(zhì)組學技術(shù)為疾病機制解析提供了高精度的分子圖譜。本研究的檢測流程與數(shù)據(jù)分析策略可為同類研究提供參考,同時為肝癌靶向治療標志物的篩選奠定基礎(chǔ)。

(注:本文內(nèi)容為模擬分析報告,實際數(shù)據(jù)需以實驗為準。)

實驗儀器

實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器 實驗室儀器

測試流程

蛋白質(zhì)組學檢測流程

注意事項

1.具體的試驗周期以工程師告知的為準。

2.文章中的圖片或者標準以及具體的試驗方案僅供參考,因為每個樣品和項目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準。

3.關(guān)于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗周期一般是五個工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對于(蛋白質(zhì)組學檢測)還有什么疑問,可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

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