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小鼠微生物檢測(cè)

原創(chuàng)發(fā)布者:北檢院    發(fā)布時(shí)間:2025-04-09     點(diǎn)擊數(shù):

獲取試驗(yàn)方案?獲取試驗(yàn)報(bào)價(jià)?獲取試驗(yàn)周期?

注意:因業(yè)務(wù)調(diào)整,暫不接受個(gè)人委托測(cè)試望見諒。

小鼠腸道微生物組檢測(cè)分析報(bào)告

檢測(cè)樣品

本次檢測(cè)的樣品為健康成年C57BL/6小鼠的腸道內(nèi)容物與糞便樣本,共包含3組實(shí)驗(yàn)組與1組對(duì)照組,每組5只小鼠。所有樣本均通過(guò)無(wú)菌操作采集,并于-80℃超低溫冰箱中保存,避免微生物活性與DNA降解。

檢測(cè)項(xiàng)目

  1. 腸道菌群多樣性分析:包括α多樣性(物種豐度與均勻度)與β多樣性(組間差異分析)。
  2. 核心菌群組成檢測(cè):鑒定門、綱、目、科、屬、種水平的微生物分類。
  3. 潛在致病菌篩查:針對(duì)沙門氏菌、大腸桿菌、幽門螺桿菌等常見致病菌進(jìn)行特異性檢測(cè)。
  4. 功能基因預(yù)測(cè):基于宏基因組學(xué)分析微生物代謝通路與功能潛能。

檢測(cè)方法

  1. DNA提取與純化 使用QIAamp® DNA Stool Mini Kit(Qiagen)對(duì)樣本進(jìn)行微生物總DNA提取,通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳與NanoDrop分光光度計(jì)檢測(cè)DNA濃度與完整性。

  2. 16S rRNA基因擴(kuò)增與測(cè)序 針對(duì)細(xì)菌16S rRNA基因V3-V4高變區(qū)設(shè)計(jì)引物(341F/806R),通過(guò)PCR擴(kuò)增后構(gòu)建文庫(kù),采用Illumina NovaSeq 6000平臺(tái)進(jìn)行高通量雙端測(cè)序(PE250)。

  3. 生物信息學(xué)分析 原始數(shù)據(jù)經(jīng)質(zhì)控(Trimmomatic過(guò)濾低質(zhì)量序列)后,使用QIIME2分析流程進(jìn)行物種注釋(基于SILVA數(shù)據(jù)庫(kù))與多樣性計(jì)算;致病菌檢測(cè)通過(guò)BLAST比對(duì)NCBI病原菌數(shù)據(jù)庫(kù)完成。

  4. 統(tǒng)計(jì)與可視化 采用R語(yǔ)言(vegan包)進(jìn)行組間差異顯著性檢驗(yàn),結(jié)果通過(guò)LEfSe分析篩選標(biāo)志性物種,并使用Heatmap、PCA圖等形式展示。

檢測(cè)儀器

  1. 核酸提取與定量

    • 離心機(jī):Eppendorf Centrifuge 5424 R
    • 分光光度計(jì):Thermo Scientific NanoDrop 2000
  2. PCR擴(kuò)增與文庫(kù)構(gòu)建

    • PCR儀:Bio-Rad T100 Thermal Cycler
    • 自動(dòng)化工作站:Beckman Coulter Biomek 4000
  3. 高通量測(cè)序

    • 測(cè)序平臺(tái):Illumina NovaSeq 6000
  4. 數(shù)據(jù)分析

    • 高性能計(jì)算集群:DELL PowerEdge R740(Linux系統(tǒng))

結(jié)語(yǔ)

本研究通過(guò)多組學(xué)技術(shù)系統(tǒng)解析了小鼠腸道微生物的組成與功能特征,為后續(xù)研究菌群與宿主健康的關(guān)聯(lián)提供了數(shù)據(jù)支持。標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)流程與高精度儀器的結(jié)合,確保了檢測(cè)結(jié)果的可靠性與重復(fù)性。未來(lái)可進(jìn)一步結(jié)合代謝組學(xué),深入探究微生物代謝產(chǎn)物對(duì)宿主的調(diào)控機(jī)制。

(本文為模擬分析報(bào)告,實(shí)際實(shí)驗(yàn)需根據(jù)具體需求調(diào)整方案。)

實(shí)驗(yàn)儀器

實(shí)驗(yàn)室儀器 實(shí)驗(yàn)室儀器 實(shí)驗(yàn)室儀器 實(shí)驗(yàn)室儀器

測(cè)試流程

小鼠微生物檢測(cè)流程

注意事項(xiàng)

1.具體的試驗(yàn)周期以工程師告知的為準(zhǔn)。

2.文章中的圖片或者標(biāo)準(zhǔn)以及具體的試驗(yàn)方案僅供參考,因?yàn)槊總€(gè)樣品和項(xiàng)目都有所不同,所以最終以工程師告知的為準(zhǔn)。

3.關(guān)于(樣品量)的需求,最好是先咨詢我們的工程師確定,避免不必要的樣品損失。

4.加急試驗(yàn)周期一般是五個(gè)工作日左右,部分樣品有所差異

5.如果對(duì)于(小鼠微生物檢測(cè))還有什么疑問(wèn),可以咨詢我們的工程師為您一一解答。

  • 服務(wù)保障 一對(duì)一品質(zhì)服務(wù)
  • 定制方案 提供非標(biāo)定制試驗(yàn)方案
  • 保密協(xié)議 簽訂保密協(xié)議,嚴(yán)格保護(hù)客戶隱私
  • 全國(guó)取樣/寄樣 全國(guó)上門取樣/寄樣/現(xiàn)場(chǎng)試驗(yàn)